承接前作的《医馆笑传》，《医馆笑传2》讲述了靖王府几经波折，终于圆满地迎来了小郡主之后的故事。
然而，好景不长。朱一品、白敬祺二人意外结识了一个名叫许一城的医馆馆主。许一城医术高超，为人谦和，却偏偏爱慕朱一品。这一厢情愿的感情，让本就复杂的王府后院更加波澜起伏。
与此同时，武林盟主驾到靖王府，带来了一块神秘的龙鳞玉佩。传说龙鳞玉佩的 обладатель сможет управлять миром, но его владельцем может стать кто угодно. Эта новость вызывает ажиотаж среди жителей столицы и привлекает внимание многих мастеров боевых искусств.
为了争夺龙鳞玉佩，各路江湖人士纷纷涌入靖王府，武林盟主也暗中派人监视。王府一时间风起云涌，朱一品、白敬祺、许一城三人卷入了这场武林纷争。
除了江湖争斗，靖王府还面临着内部危机。王夫人嫉妒朱一品受宠，处处与她作对。小郡主突发疾病，府中无良太医竟趁机陷害朱一品。面对重重困境，朱一品临危不乱，凭借高超的医术和过人的智慧一次次化险为夷。
然而，随着调查的深入，朱一品发现这起江湖争斗背后隐藏着更大的阴谋。有人利用龙鳞玉佩挑起武林纷争，企图扰乱朝廷。面对强敌，朱一品、白敬祺、许一城三人联手，运用他们的智慧和武功，机智应对，最终粉碎了敌人的阴谋。
在这一系列的考验中，朱一品与白敬祺的感情日益深厚。他们相互扶持，患难与共，最终走到了一起。许一城虽然没能得到朱一品的芳心，但也明白了自己的感情，放下了执念。
靖王府恢复了往日的平静，朱一品和白敬祺幸福地生活在一起。他们医术精湛，仁心仁术，为百姓们解除了病痛，赢得了人们的尊敬和爱戴。而王府中的其他成员也在他们的感召下，变得更加团结和谐。
《医馆笑传2》延续了前作的轻松幽默风格，在欢声笑语中传递着正义、善良和爱情的真谛。它证明了即使是在最复杂的处境中，只要保持初心，坚持不懈，最终也能化解危机，迎来美好的结局。